A differenza di altri programmi antivirus, GreenBorder non combatte direttamente i virus o il malware in genere, ma agisce piuttosto come un firewall che si frappone tra l'applicazione web e il codice aggressivo; ciò impedirebbe furto d'identità o di password o comunque la diffusione dei dati personali o riservati. Queste almeno le affermazioni di Bernard Harguindeguy, patron della ditta che produce l'omonimo programma.

In sostanza GreenBorder si installa allo start-up di Windows e poi resta in memoria, pronto a lanciare una sessione virtuale ogni volta che si contatti un sito web o si inizi a chattare con qualcuno. Ciò crea una sorta di divisione insormontabile tra l'applicazione e il sistema operativo allo scopo di impedire al malware di installarsi sul Pc.

Tuttavia GreenBorder non è un vero antivirus, ma piuttosto un prodotto complementare, superiore per tanti versi a programmi tradizionali per quanto riguarda gli attacchi provenienti dal web perché non lavora sulla base di elenchi di "firme" virali o di una ricerca euristica segnalando probabilità di rischi d'infezione; ma è assolutamente non risolutivo quando l'attacco proviene ad esempio dall'interno dell'intranet o magari da un dischetto o una chiave Usb contenente un virus.